>MA0913.1	Hoxd9
A  [    75     24    194    194     13     99    194    194    194     83 ]
C  [    44    275     77      2      7      3      2      7     26     28 ]
G  [   194     12     36     31      7      0      0      0     40     19 ]
T  [     9    194      0      5    194     95     17      7     44     65 ]
>MA0913.2	HOXD9
A  [  1300      0  16363  16363    215  16363  16363  16363  16363   4149 ]
C  [   872   9773   8643    226      0      8      0      0   2202   5804 ]
G  [ 16363     42    675    439      0      0      0      0   1216   2169 ]
T  [   655   6590    927      4  16363   5445    123      0   2194   4241 ]
>MA0913.3	HOXD9
A  [  1300      0  16363  16363    215  16363  16363  16363  16363 ]
C  [   872   9773   8643    226      0      8      0      0   2202 ]
G  [ 16363     42    675    439      0      0      0      0   1216 ]
T  [   655   6590    927      4  16363   5445    123      0   2194 ]